VISI
“MENUJU KARANTINA PERTANIAN YANG MODERN DAN TERPERCAYA TAHUN 2009 SERTA TERHANDAL DI ASIA TENGGARA PADA TAHUN 2014”

MISI
“MELINDUNGI PERTANIAN INDONESIA DARI ANCAMAN MASUK DAN TERSEBARNYA HPHK DAN OPTK KE WILAYAH RI, MENDUKUNG AKSELERASI EKSPOR KOMODITAS PERTANIAN SERTA PENGAWASAN HAYATI DAN KETAHANAN PANGAN”.